O percurso do Rio Gonde inicia-se na Quinta do Marinheiro, onde está situada a Casa Museu Egas Moniz. Este local é atravessado pelas águas do rio Gonde, que outrora eram utilizadas para a irrigação e para alimentar um lago romântico. A água segue por uma levada até aos Moinhos de Meias, localizados no fundo da quinta, agora restaurados e abertos ao público, evocando a antiga atividade dos moleiros, que transformavam cereais em farinha.
Com uma extensão de cerca de 3,5 km, o trajeto acompanha as margens do rio, caracterizadas pela típica vegetação ripícola. Ao longo do caminho, o visitante pode observar os antigos moinhos de água, bem como atravessar áreas de pinhais e eucaliptais até chegar à Ribeira do Mourão, rodeada por extensos caniçais. Estes biótopos abrigam espécies únicas de fauna e flora, que dependem deste sistema húmido para sobreviver, reforçando a importância da sua conservação e preservação.